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“仮想スーパーコンピュータ”で研究に貢献

1 :あるケミストさん:2001/04/07(土) 11:46
やってミソ。

http://www.intel.com/cure/

2 :あるケミストさん:2001/04/08(日) 00:56
アメ公の利益になるだけ。

3 :あるケミストさん:2001/04/08(日) 01:09
鬼畜米英

4 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/08(日) 04:44
Folding@home
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/Cosm/
宇宙人でも難病の少女でもない

5 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/08(日) 06:14
あ、このIntelのプロジェクトって分子式も表示されるんだ。
でもマウスでグリグリ出来ないのはちょっとな〜

とりあえずやってみてる。
企業の手伝いが嫌なら>>4をやってみて

6 :あるケミストさん:2001/04/08(日) 18:50
こっちでもやってる。
http://piza.2ch.net/test/read.cgi?bbs=jisaku&key=986476891

7 :あるケミストさん:2001/04/09(月) 15:04
30時間やっても67%で返信できない…
 当方 K6-III/400
参戦者求む
''Team 2ch''
http://members.ud.com/services/teams/team.htm?id=270E60B7-EC7B-4389-BA40-8C473D6C5A5B

8 :あるケミストさん:2001/04/11(水) 23:21
ばけ板にもあったのね、これ。
ところで、このプログラム、いったい何を計算してるんでしょうねぇ。

9 :あるケミストさん:2001/04/12(木) 03:00
タンパク質表面と立体障害が発生せず
静電的相互作用を示す分子を探索しているだけと思われ

10 :あるケミストさん:2001/04/12(木) 09:32
>タンパク質表面と立体障害が発生せず
>静電的相互作用を示す分子を探索しているだけと思われ

それでドラッグデザインできれば苦労しねえぜ、と思われ
とはいえ、それをいつの間にか全世界的プロジェクトに立ち上げる
行動力は、うらやましく思われ

11 :あるケミストさん:2001/04/12(木) 09:44
触媒探索なんかにも使えんかね、この手法


12 :あるケミストさん:2001/04/12(木) 21:42
http://mentai.2ch.net/test/read.cgi?bbs=bake&key=986611570
/ヌオヌ「ヌアヌ*ヌユヌアヌヌチヌ=ナB
裹aノXノ衂テノKノCノhノ篷Cノ



13 :あるケミストさん:2001/04/12(木) 22:49
Team 2ch 2,234 Public 04/05/2001
A UK PC against Cancer 1,331 Public 04/03/2001
TECHSIDE.NET 1,312 Public 04/07/2001
Vulture Central II 1,169 Public 04/03/2001
AMDZone.com 1,075 Public 04/03/2001


14 :あるケミストさん:2001/04/13(金) 00:18
酸化しまっす

15 :あるケミストさん:2001/04/13(金) 12:14
んでものが見つかったらだれの権利になるんだよ?
発案者が世界の善意のを借りて特許独り占めじゃねぇだろうな

16 :あるケミストさん:2001/04/13(金) 13:02
                ◇◆◇◆ 最新状況 ◆◇◆◇
Team Name               Members*    Points          CPU Time
--------------------------------------------------------------------------
Team 2ch.                  2,537   201.245 (+135,832).    3:029:12:59:32
TECHSIDE.NET                1,359   520,185 (+172,526).    7:087:06:11:57
A UK PC against Cancer        1,337   955,821 (+163,069)   11:277:04:38:50
Vulture Central II..            1,177  1,287,597 (+223,091)   16:227:11:42:56
AMDZone.com               1,089  1,040,709 (+197,687)   12:132:22:23:47
Black & White.                750.    83,753 (+. 56,243).    1:020:16:35:38
NCTU Taiwan                 710   321,369 (+. 82,420).    5:278:08:47:14
Intel Against Cancer.            709  1,132,237 (+221,560)   14:165:07:28:35
Hungary.                    553   334,575 (+. 63,846).    4:060:22:54:55
Dutch Power Cows against cancer .   486   411,510 (+. 70,890).    5:230:14:11:02
--------------------------------------------------------------------------
(*MembersはRetieredを引いた人数)                 (2001/04/13 10:50 JST)
※ 人数の割には、ポイント獲得数が……。(Inactiveがチョット増えてる)



17 :あるケミストさん:2001/04/13(金) 20:03
>>15
当然アメ公の一人占めです。
他人の塩基配列を無断で特許取得する連中だぜ?

18 :あるケミストさん:2001/04/13(金) 23:12
このプロジェクトでモノが見つかると思う人は参加しなくて(・∀・)イイ!

19 :あるケミストさん:2001/04/14(土) 01:49
どきゅその質問ですまそ。
暗号を総当たりで調べるごとく、総当たりで白血病の細胞を死滅させるべく特有の蛋白質(superoxide_dismutase)に当てはまる分子をさがしているそうだが
ターゲットの分子構造から当てはまる分子を求めるということはできないの?

20 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/14(土) 09:56
>>19
ターゲットの分子構造?
タンパク質の立体構造が示されているのにこれ以上何が知りたいのか

21 :あるケミストさん:2001/04/14(土) 10:17
本日の集計

http://www.geocities.co.jp/Technopolis-Mars/6485/index.html

2001/04/14をクリック。ラウンジより転載。

22 :19:2001/04/14(土) 12:43
いやそういうことじゃなくって

このプロジェクトで探している分子は総当たりで検索するのではなくて
論理的にこういう分子であるということで求めることはできないのでしょうか?


23 :あるケミストさん:2001/04/14(土) 15:37
候補分子の中に当たりがあるとは限らない。
計算上良い分子が見つかっても、実際にタンパク分子と相互作用があるとは限らないし、
合成できるような分子であるとも限らないし、合成できても人間に投与できるとは限らない。

24 :あるケミストさん:2001/04/14(土) 16:02
>>19
それが出来たら理想だわな。
標的タンパクの3次構造やら活性部位やら本来の基質からある程度は推測できるはずだけど、
候補物質をほとんど絞りこむ事はできない。
一定以上の活性を示す候補分子から定量的構造活性相関を求めて分子修飾やら
基本骨格の決定をするってところか。

http://www.cbi.or.jp/cbi/CBInews-old/9603NEWS/9603NEWS.html
http://www.cbi.or.jp/cbi/CBInews-old/9507NEWS/9507NEWS.html
http://cssjweb.chem.eng.himeji-tech.ac.jp/jcs/v4n4/a3/textj.html

25 :19:2001/04/14(土) 19:55
そうなんですか世の中あまくないんですね。勉強になりました。

シベロンブロックは商品化されているので、
鍵穴に入る物質って簡単にみつかるのかなあ?とおもったもので。
どきゅそですまそ。

26 :あるケミストさん:2001/04/14(土) 22:03
>>19
たとえば今回求める分子がタンパク質に対し静電的相互作用が必要だとしよう。
タンパク質の相互作用を起こす部位は限られているので、それと対になる位置に仮想的双極子を持つ仮想分子を想定する。
つまりその仮想分子がもっとも薬効が高い化合物となる。

今度はその仮想分子と実際の分子のマッチングを確認していく。双極子の位置・角度・極性など。
さらにその後にタンパク質と立体障害が起きないか確認する。
なんだ、今とやってることは同じじゃないか。

これまでの化学では、仮想分子を設定し研究者が分子設計をする。
当然抜け落ちがある。(可能性)
それをコンピュータに総当たりでやらせているだけ。

シベロンブロック?
あんなのCM上の効果だよ。
こつこつ薬効を確認していって見つかった化合物に
「穴にすっぽりはまります」というイメージを植え付けただけ。

27 :19:2001/04/14(土) 23:20
難しい話はよくわかりませんが

設計によりある程度候補を絞り、そこから総当たりで発見する。
ということですね。発明というよりは発見なんですね。

シベロンブロックの話は厨房まるだしでした。すみません。

28 :あるケミストさん:2001/04/15(日) 01:38
すまん、難しい方向に逝ってしまったか?

この方法は「総当たり」、つまり泥臭いんだ。
でもそれを敢えてやろうとするのはすばらしい。

設計、といえばこのプロジェクトでは
・対象タンパク質
・計算方法
・宣伝方法
あたりが設計に含まれる。
候補はほとんど絞ってないよ。総当たりするためにね。
総当たりするときには「可能性はほとんどない」モノも含めるべき。
「絶対にあり得ない」ときだけ候補から外せる。
だって、これからコンピュータが計算してくれるんだよ?

発明・発見の境は微妙だな。
方法論は10年以上前から有る。
手段はSETI@HOMEであらかた見えた。
今回のプロジェクトが成功(メンバー数が確実に増えている)したのは
宣伝の仕方が上手かったから、と言える。どちらかといえば発明かな

シベロンブロック、喩えとしては(・∀・)イイ! よ
日常生活で「特異的」なモノはやはり鍵穴だし。
でもこのプロジェクトでも簡単には見つからないんだよな、きっと


29 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/15(日) 18:18
チアゾロンの解析に入った。
でもナフタレン環が付いてる。こんなん邪魔で入り込めないって。
hitは期待できないな

30 :あるケミストさん:2001/04/15(日) 22:10
さっき熱暴走して四時間無駄になりました。鬱氏。

31 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/15(日) 23:26
今度はベンジルオキシベンゼン誘導体。
しかも2級アミン、エーテルが繋がってて自由度高すぎ。conformers多そう

32 :あるケミストさん:2001/04/15(日) 23:39
うちも今エーテルが流行中。
フランとか複素環が挟まると重くなるような気がする…

33 :あるケミストさん:2001/04/16(月) 00:20
六本腕の酸素2つ、八本腕のheteroが4つある糞気持ち悪い分子を解析中。
シクロプロパンとおぼしき環もある。こんなん存在できるわけねーっつーの。

34 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/16(月) 04:27
オキサゾロン+ベンジルオキシベンジルになっちゃった。
意味ね〜。10hrsで0hit

35 :あるケミストさん:2001/04/16(月) 16:49
たまにconformersの上にde novoなんたらって出てくるんですけどなんなんでしょう?

36 :あるケミストさん:2001/04/16(月) 18:28
>>35
FAQの日本語訳に簡単な内容があったぞ。
人に説明するのって労力いるものだから、
アレ読んで、ここが判らないって聞き方するのが
いいと思うよ。


37 :あるケミストさん:2001/04/16(月) 18:37
すいません、他板から来ました。
時間かかりそうなやつって、見た目の特徴はどんな感じなのでしょうか。
「灰色の六角形がたくさんあるやつ」みたいな目安があったらお願いします。

38 :あるケミストさん:2001/04/17(火) 01:17
>>37
・自由度の高いヤツ。1本で結合していて、回転できるヤツ。
・極性を持っているヤツ。酸素・窒素・リン・異種原子が多いヤツ。

酸素が10個ぐらい付いている分子は100,000,000 conformersくらい探してた。
自由度はそれほど無いように見えたんだけど、時間ばっかりかかった。

39 :37じゃありませんが:2001/04/17(火) 03:26
>>38さん。ためになりましたです、ありがとう。ここはいつもロムってます・・

40 :22世紀を目指す名無しさん:2001/04/17(火) 03:59
ラウンジから散歩にきました。
>>36
de novoは日本語に適当な訳はないんでしょうか?
高校の授業で、同じ化学式でも左右対称の別構造があるとか
習ったような覚えがあるんですけど、あれじゃないですよね?

41 :あるケミストさん:2001/04/17(火) 09:29
なんだろう、医学系ではde novoで"新種"のような使い方をしている。
de novo癌という言い方が普通。自発癌という意味。(転移癌に対して)
化学的には新種という概念はおかしいので派生種とでも言おうか。

同じ分子式なのはconformer
同じ組成式だが分子式が異なるのはconfigurer
de novoは同じ組成式ですらない。
>>33に出てきた6本腕の酸素もde novoのような気がする。

42 :37:2001/04/17(火) 21:03
>>38
ありがとうございます。
素人ですがなんとなく理解できました。
自分でも少し検索かけて調べてみることにします。

43 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/18(水) 00:40
今日de novoの計算のところで引っかかった。放置したら普通に計算した。

current molecule:****-100、de novo structures***、****** conformers
あたりでconformersの数字がぴたりと止まった。
でもCPU timeはcount up続けてる。
snooze-exitして再起動したけど
current molecule:****-100、de novo structures***、0 conformers
でstop、CPU timeはcount up
そのまま放置したらそのうち普通に計算していた。

まあ他の所でも似たような報告はあるわけで…

44 :あるケミストさん:2001/04/18(水) 00:44
どう見ても水素から腕が2本出てる…
そんなことあるのか?

45 :あるケミストさん:2001/04/18(水) 02:04
ジボランの存在などから考えて
「あり得ない」と断言できるほどの自信はありません。
合成しろと言われれば即答します。
「無理」

46 :糸小:2001/04/18(水) 02:46
>41
カガクバカのわたしはしりませんでした・・・


47 :あるケミストさん:2001/04/18(水) 10:54
アメリカは世界中のCPUタイムを独占しようとしている。
これでほんとにカネになる薬ができたら日本の製薬産業は・・・
だれか和製peer-to-peerつくってくれ

48 :あるケミストさん:2001/04/18(水) 12:35
Intelのおかげなんだろうけど、計算時間も結構集まってるな。
アメリカの企業がとかぐだぐだ言っててもしょうがないよ。

おい、計算化学屋のタマゴ、この方法は金になることが証明されたぞ!!
リバースエンジニアリングして日本の企業に売れ。
学生ベンチャーは夢じゃないぞ


49 :37:2001/04/18(水) 17:47
>>48
しかし、この方法で得た結果を独占すると
企業イメージが著しく損なわれるのでは。


50 :あるケミストさん:2001/04/18(水) 19:03
>>49
最初から、
「独占する代わりにPSoneをあげます」と宣言するとか。

51 :あるケミストさん:2001/04/18(水) 23:00
ちなみにUDは計算結果は公表するらしい。
2ちゃんのFAQとかで探してね。
(大元でえいごで説明してるけど)

52 :だめケミストさん:2001/04/19(木) 01:52
まず、この解析に使うデータ自体が無償で提供されてる事を忘れないように。

あと、ラウンジからお土産。
http://www.nikkei.co.jp/news/sangyo/20010418CTTI013718.html
NEC的にはこのプロジェクトどーなんだろうね。

53 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 10:08
>>51
結果が出次第すぐに公表、とはかぎらないよ。
公表までに知的所有権をおさえてしまうかもしれぬ

54 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 10:48
このプロジェクトの計算結果では特許は取得できないと思うけどね.
特許を取得するならこの"計算手法"でしょう

55 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 15:20
わからんぞ アメリカのやることだから
自国の利益になるような特許のルールを決めてしまうかも
しれん

56 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 17:54
>>55
そこまで当てずっぽうに疑えるのもある種の才能だなぁ。

このUD関連のスレを順番にageながら荒らしてるのは君?
同人板で言いくるめられてこっちに移動ですか?

57 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 18:24
あてずっぽう?
ほんとに結果が出てからじゃ遅いんだよ。こういうことを
かんがえるのは。
特許は取れないかもしれんが(ただしタンパクでホモロジーが
あったくらいで特許になるくらいだからこれだってどうなるか)
研究成果とられて主導権とられたら追いつくの大変だよ?

> このUD関連のスレを順番にageながら荒らしてるのは君?
>同人板で言いくるめられてこっちに移動ですか?

それはしらん。

58 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 21:25
アホには何を言っても無駄。

59 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 21:49
>>57
>遅いんだよ。こういうことをかんがえるのは。
あなた考えるの遅すぎです。

>研究成果とられて
UDagentの計算結果はそれなりの成果だと思われ

>主導権とられ
先進性は認めましょう

>追いつくの大変だよ
私はこの分野で生業を立てているわけじゃないので
全然構いません。何か問題でも?

60 :あるケミストさん:2001/04/19(木) 22:37
あと、ある程度の成果を上げれば、同種のプロジェクトが今後増えていくでしょう。

計算機の得意分野で分散コンピューティングの道を切り開いたdistributed.net
夢を全面に押し出して一般への浸透を図ったSETI@Home
そして、より実用的な方面での成果を求める今回のプロジェクトcure cancer

あなたは、どう評価しますか?

61 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 02:41
>>60

夢と言いつつ特定の会社(機関)の利益のみをはかるので有れば
国際的な詐欺行為としか評価できませんね

62 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 03:46
>>61
よくよめ。「夢」ということばが「どこ」に出てきているのか。
あんたが、UDに夢を感じているのは充分わかったから。

63 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 05:30
横から補足させてもらうけど、今回のプロジェクトが成功して
特定の企業が得をする可能性があるということは
特定の企業以外が損をする可能性があるということだよね(確認

実際ビジネスとしてそれをやろうとしている会社もあるみたいだし。
善意のボランティアとビジネスがぶつかったときに、どういう反応
が発生するかは……(以下自主規制

64 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 12:19
ボランティアが損をするわけじゃないんで別に構わん.

>>63
>特定の企業以外が損をする可能性がある
そうだよ.
でもボランティアを占め出すんじゃなくて
いかに取り込めるかが重要であるわけで.

65 :57:2001/04/20(金) 18:29
確かに考える時期を逃しているかもしれない。かといって放置しておいたらもっとじょうきょうは悪くなるとおもわれ。少なくとも日本が得意とするスパコンが売れなくなる可能性はかなりある

66 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 19:34
たしかに〜
最先端のスパコンと個人が持つPCとの性能差はどんどん狭まっている。
帯域も広くなってタダ同然で数メガのデータをやり取りされている。
善意のボランティアを利用した一種の「CPU時間の募金」的な企画は今後増えるだろう。

しかし、今回のこの企画も「世界中の患者が救われる!」とかいってるけど、
それはどの新薬でも同じなわけで。今ちょっとアメ公の手助けした所で最悪でも
新薬の一つか二つ分の利益が損なわれる程度でしかなく、米国の一企業にとっては
莫大な収入にせよ、それによって日本がすごい損害を被るとは思えないが〜
またこの企画を動かすために投資してる企業がこの企画の利益を独占するのもまた当然。
得られた結果は特許になるだろうし、特定の企業が特許権を持つ事になるだろう。
税金じゃあるまいし、集められた「募金」が公平に使われる訳無いだろ。
それがイヤなら協力しなければよい。

歴史的に見ても新しいデバイスや手法が出現すると一部の先進企業に利益が集中するのは
当然の事であって、日本企業もこれまでに相当儲けさせて貰ってるのもまた事実。
コンピュータや医薬の分野で日本が遅れを取ってるのは昨日今日の出来事ではないので
ワシは楽観視してるがのお。

67 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 20:05
別にどこだって良いんだよ.
日本対アメリカじゃないんだし,アメリカの企業が新薬開発して,出遅れた日本の企業が衰退する.
いつものことだよ.

ここでいやだいやだと駄々をこねていても,いつか誰かが作るクスリが市販されるのがちょっとかかなりか遅れるだけ.
俺にとっては企業Aが開発しようが企業Bが開発しようがどっちだっていい.
え,日本の景気が悪くなる? 知ったこっちゃないよ.
たかだかこんなソフトの登場で景気が左右される国のことなんか.

企業Bの人にはもっとやりがいのあるソフトの開発をお願いするよ.
いい感じなソフトが出来れば乗り換えないこともない.
まあ日本の企業じゃまだまだ動けないだろうね.
こんな草の根活動の有効性を判断するのに時間がかかって.

68 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 21:17
>>67
偏ってはいるが、間違いでは無い。

69 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 21:37
ていうか共産主義者がこんなに多いとは思わなかった。
資本主義ってこんなにも理解されてなかったのか。
お金=悪という発想がステレオタイプなんだよね。

70 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 21:46
>>69
国際競争って言葉を知ってますか?

71 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 21:48
共産主義という考え自体は非常に理想的だ、嫌いではない。
完全に実現したら正にそこはユートピアと呼ぶにふさわしい世界であろう。
だが、人間の本能や仕組みと言うものを全く考えていない実現不可能な考え方だ。
だから、この主義を極端に押し進めようとするのはただの無駄である。

ところで69はただのバカのようである。

72 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 22:25
つか、>>69 が共産主義(という言葉の意味)を理解しているとは
思えないのだが、いかに。たんにそれらしい言葉を思いついたので
言ってみただけとか。そういう「におい」がするのだが。

73 :57:2001/04/20(金) 22:35
67の意見は理解します。私も製薬業界でも計算機メーカーでもないので
そういう意味では特に関知するところではないは確か。
ただ気づくべき人達が気づいてないのでは、という危惧はものすご
く持っている。たぶんseti@homeが話題になったときにそこまで
気づくべきだったんだろうけど、あいにく日本では気づいた人が
いなかった(または声が小さかった)らしい。
そういえば60に答えていなかった。
私もUDの技術(というよりむしろアイディア)は画期的だとおもう。
これから伸びていく技術だと思うし、伸ばして行くべきだろうと思う。
ただ、それにあわせて制度面を整備する必要があると言うことを
いいたい。


74 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 22:38
そう。>>69はただのバカ。

共産主義者は多くない。
日本語をしゃべる人の中に、資本主義を理解できていない人が多いだけ
ちなみにそういう人は民主主義も理解できていないことが多い。
なお、
>お金=悪という発想がステレオタイプ
という発想がステレオタイプ (w


75 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 22:46
>>73
よくわかっていないので質問しておきます。
整備すべき制度というのはどのような部分でしょう。

76 :73:2001/04/20(金) 23:09
不特定多数の他人の資材を使って(しかも無償で)おこなった研究で、
どのように工業所有権をとりあつかうのか?
別板で献血(無償)→輸血(有償)のようなものではという議論も
されてるみたいだけど、そんな簡単なものではないように思う。
私は特許の専門家ではないのでよく分からないが、現段階では知的財産に
なるともならないとも言えないと思う。

インテルの場合には「公開する」をそのまま信じればいいのかも
知れないが、かりにほんとにビジネスになるような化合物が見つ
かったとして、「こういうすばらしいものができました」と主催
した会社が言わない場合も想定される。そういう場合のチェック
機能は今のところ全くチェックできない。
スクリーンセーバーで動いてるのとは全く別の計算をさせるかも
しれない。これって一種の詐欺に当たるのか(今はたぶん当たら
ない)?

ほかにも考えれば思いつくことは結構あると思う。


77 :あるケミストさん:2001/04/20(金) 23:29
私も特許の専門家ではないのですが、
計算プログラム、計算データを公開しており、その「計算結果」では特許は取得できないのでは?
と考えています。
もちろん計算プログラム自体は特許取得可能です。

計算結果を考察して、有効成分を「一般化」した場合は特許取得は可能ですが、
一般化の仕方が不十分、一部の漏れがある、別の解釈がある場合は
優先期間が切れ公開されたときに、逆襲されることもあり得ます。
もちろん計算結果で「可能性がある」化合物をすべて個別に特許取得することは可能ですが、
効果がないことが証明されるまでその特許を維持するかと思うと
私はそれはないんじゃないかと思います。

「公開する/しない」に関して、私は団体の良心に期待しています。
公開が遅い、いつまで経っても公開しない、つーか製品が先に出た場合にはIntelを含め覚えてろよ、になります。
まさか使い捨て団体!? なんて、はは…

全て否定は出来ない。俺って騙されやすい性格かも。鬱だ

78 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 00:13
この板の方ならすでにチェック済みの人もおられるとは思うが、

■参考資料。、
「南アで英製薬会社、エイズ薬特許侵害訴え取り下げ」
http://www.yomiuri.co.jp/05/20010419id28.htm

79 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 00:57
>>77
計算結果までは公開して無いでしょ。既知にはなってない。
結果を公表するとは言ってるようだが、新規物質の全ての権利を
公にするとまでは言って無い。逃げ道はいくらでもある。
手段が公でも、新規物質が既知でなければ新規技術として特許性がある。
しかも明白に「新薬の開発に無償で協力してください」という条件だ。
それに同意してる以上は「従事者の一部」と見なされて「データは公にしてない」
と言い張るかもしれない。どんな企画でも従事者を公に募るのは当然だからな。
「無償の協力」といえば当たりは良いが、要は「タダ働き」だよ。
そんなにすごい新薬なら無償で公開する訳が無いだろ。
あの手この手で権利を独占するに決まってるよ。
事実上、産業上の利益を保護するのは特許しか無いからな。
この計算結果から実際の新薬に結びついたら間違い無く特許は取ると断言できるね。

80 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 01:30
>>76
UDをインストールするときに「UD SOFTWARE LICENSE AGREEMENT」って個所で
「accept」って押したでしょ?それは「契約に同意する」って意味のボタンだ。
UDのメンバはPCを無償で貸してるだけで、計算内容も計算結果も主催者の所有。
インストールする過程であなたはそれに同意した事になってる。

エジソンが他人のガレージを借りて発明をしても、発明の権利はエジソンの物だ。
企業内での発明の場合は就労規則で「発明は企業の物になる」と定められてる筈だ。
UDの場合は主催者の所有になる。なぜならそういう契約だから。

81 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 07:01
君のパソコンで抗ガン剤を開発
http://www.hotwired.co.jp/news/news/technology/story/20010405305.html
より、
> シンク・ソフトウェアは、小分子が、抗ガン剤のターゲットとなる
> 可能性のあるタンパク質とどのくらい結合しやすいかを評価する。
> ソフトウェアはその結果をセンターに送り返し、分析すべき新しい
>データを受け取る。このプロジェクトにより、新薬の開発を、多けれ
>ば5年早めることができるだろうと、科学者たちは考えている。
(略)
> 薬学者たちはこれまで、薬の開発に結びつきそうな物質を探して、
>それぞれに試行錯誤を繰り返しながら研究を続けてきた。タンパク質
>との結合が可能な物質はすべて、潜在的に薬剤の基となると考え
>られている。
> しかし、この「潜在的」というところがくせ者だ。ある化学物質が
>最終的に薬として実用化されるまでには、長い年月と、莫大な金がかかる。
> 化学者が単独で行なうのではなく、世界中のパソコンを使うこの
>プロジェクトは、いわば600万人の研究者が研究に加わるようなものだ。
(略)
>プロジェクトではすでに、2億5000万種類の分子がスクリーニング用
>に準備されている。研究者たちは、分散コンピューティングにより
>これらがすべてチェックされ、このうち1万種類ほどが次の開発段階へ
>とつながればと期待している
(略)
> 現時点では、大学や産業界の研究者たちは、どのヒットが有効な
>薬剤になる可能性があるかをつかむ実験のために、公開された情報を
>使うことができる。特許申請をするのは、もっと後のことになるだろう。
> 「スクリーニング試験を臨床検査にもっていくまでには、莫大な金額が
>必要となるだろう」とリチャーズ博士は述べた。


82 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 12:24
>>81
無駄だよ。
79のような奴は、人の話を聞かないものだ。
彼らは自分の反対意見を読むとき、最初から先入観を持って否定的な態度のままだから、
誰が何を言っても、識者へのリンクを張っても、理解しようとしないだろう。
最初にうけた悪印象だけで批判してるんだよ。
ちゃんと調べたら、言ってることメチャクチャだってすぐわかるはずだ。

83 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 13:02
>>79
物質特許を取得するには合成し単離しなければなりません。
あなたはUDagentのプログラムが見つけた、中学生が線を一本足しただけのような化合物を
合成できますか? しかもそれは薬効などがほとんど期待できない数万種類のうちの一つだというのに。

>>80
企業が取得するのは日本の事情です。
アメリカでは企業は特許を取得できません。必ず個人が取得します。

84 :76:2001/04/21(土) 15:23
>>80
私はUDインストールしてません。通信代まで払わされてCPU
タイム貸してやるなんて納得いかないから。
そういう契約になってるのであればインテルの例では結果は
インテルのものになってしまうのだろうけど。
今はみんな「善意」でやってるけど、一般論として,今後
こういう手法が普及してくると善意だけでは片付かなく
なってくるはずだと思う。
>>83
UDの場合はそうだと思うけど、今後似たようなプログラムで
もっと現実的に産業につながりそうな計算をやらせることだって
できるわけだよね。そういう事態を私は想定してるんだけど。


85 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 16:44
>>83
遺伝子やタンパクのように構造と産業上の効果がわかれば、合成も単離も必須では無い。
同じ効果を期待できる数百の化学物質が一つの発明として登録されるのは普通だ。
さもなければ「ちょっとOHを付けただけ」の分子が別の特許として成立しかねない。
化学的に別の分子でも産業上の効果は変わらないので同じ技術とみなされる。

86 :あるケミストさん:2001/04/21(土) 22:09
物質特許の話をしていると思ったのに。
何時の間に用法特許の話になるんだ?

用法特許では同じ効果がある物質は一つの特許にまとめる。
審査中に物質をどんどん追加していく。
新しい特許が出るのは効果が著しいとき。そのときは比較試験をするのが普通。
「癌の治療薬」であれはこれまでの薬に対してどのようなアドバンテージがあるのか
明らかにしないとね。というわけで普通は合成してから特許でしょ。

87 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/04/23(月) 01:23
今日はシクロプロピル、シクロブチルを見た。
3.3.0-ビシクロも見た。6.4.0.0^2,6-トリシクロも見た。なんて日だ。
しかもそのシクロプロピルが実は4.4.0.0^2,4だったり
シクロブチルが5.4.0.0^2,5だったりもする。

88 :えっちひぞいれ:2001/04/23(月) 23:30
>>85
君さ、新規性と進歩性の原則って知ってる?
>>86
用法特許? 用途のことかい?


89 :あるケミストさん:2001/04/24(火) 02:04
86
ああ、用途特許か。

90 :あるケミストさん:2001/04/24(火) 22:07
能書き垂れてる2ちゃんねらーよ
・・・・・・・・・・・・・・・
・・・・・・・・・・・・・・・
・・・・・・・・・・・・・・・
・・・・・・・・・・・・・・・
・・・・・・・・・・・・・はぁ

溜息しか出てこないよ

91 :イソテル女:2001/04/29(日) 07:20
>>4
これの詳しい情報とインストール方法希望
英語わかんないんだーー。
これもUDと同じ空き時間での解析かな?
教えてくれ〜〜。



92 :あるケミストさん:2001/04/29(日) 09:07
SETI@home Team 2ch ツクタヨ(・∀・)
http://yasai.2ch.net/test/read.cgi?bbs=event&key=../kako/985/985785617

 ※こちらのリンクからどうぞ。

93 :   ↑:2001/04/29(日) 09:08
   誤爆でした(・∀・)ノ

94 :あるケミストさん:2001/04/29(日) 10:18
>>91
インストール方法はないけど、Hotwired の記事
http://www.hotwired.co.jp/news/news/Technology/story/20000928306.html


95 :あるケミストさん:2001/04/29(日) 10:23
ついでにもひとつ

分散コンピューティングでタンパク質とゲノムの関係を解明
Andy Patrizio
2001年2月17日 2:00am PSThttp://www.hotwired.co.jp/news/news/20010302305.html


96 :あるケミストさん:2001/04/29(日) 15:22
>>91
計算の意義とか書いた方が(・∀・)イイ! のかな? わかんないから他の人にタッチ

スクリーンセーバー版とコンソール版があって、スクリーンセーバーしか使ったことがないけど、
セーバーが表示されているとき、計算が行われる。
UD Agentに比べるとかなり重い。(MMX200でやる計算じゃない)
サーバーと通信するタイミングは不明。(ダイアルアップでも出来るみたい)

インストール方法(スクリーンセーバー版)
名前を入れる(何でも(・∀・)イイ! )
インストールするフォルダを指定する
====終了====

いつの間にかスクリーンセーバーが変更されている。
詳細設定はない。

これも解析得点をサーバがまとめているから、その認識に名前を用いてる。

97 :イソテル女:2001/04/29(日) 17:03
説明ありがとう。
これから参加してみるわ。

98 :イソテル女:2001/04/30(月) 01:46
 ダウンロードしてインストールしたけど何も起こらないよ。
 http://foldingathome.stanford.edu/ winsaver134.exe
 ってのダウンロードしたけど、もしかして私間違ってる??
 誰か教えて


99 :あるケミストさん:2001/04/30(月) 02:05
「スクリーンセーバー版」だからセーバーが動かないと表示されない。
スクリーンセーバーの「プレビュー」でも計算できてるみたいだからテストしてみて

100 :イソテル女:2001/04/30(月) 02:54
コントロールパネル開けて画面→スクリーンセーバーを確認してみた。
でもスクリーンセーバーにも入っていない。なんで??

101 :あるケミストさん:2001/04/30(月) 03:12
ファイルは合ってると思う。
winsaver134.exe 668,471バイト

オンラインにしてインストールし直してみたら?

102 :イソテル女:2001/04/30(月) 22:46
やっぱり駄目だった。
なんでだろ??


103 :イソテル女:2001/05/02(水) 06:09
おとなしくUDすることにした。
いろいろ教えてくれた人ありがとう。

104 :名無し酸@危険物がいっぱい:2001/05/13(日) 15:17
TargetがBEGF proteinになってるね。 分子像が気持ち悪いよ…

105 :名無しさん@京都板じゃないよ:2001/05/16(水) 23:12
うぬぬぬ

106 :あるケミストさん:2001/06/02(土) 03:34
他板から来ました。
勉強になりました。
ありがとうage。

107 :田中洸人:2001/06/04(月) 01:04
http://www.geocities.co.jp/Technopolis-Mars/3422/mat.htm
ここを見て必死で勉強してください。

108 :( ´∀`)こ、こぴぺ:2001/06/29(金) 13:33
UDサイトが国別集計も始めました。 http://members.ud.com/stats/
メンバープロフィールを日本に変更しないと、日本に集計されないようです。
Team 2chだけでも8000人近いのに、今のところ日本人は3000人強。
メンバープロフィールの変更方法は以下の通り。

> http://members.ud.com/services/からログイン。(JavaScript on)
> 左のMy Member Profile を選択。
> CountryからJapanを選択後、SAVEボタン。

109 :( ´∀`)こ、こぴぺ:2001/06/29(金) 16:22
ラウンジから
ttp://www3.neocity.to/treebbs/view.cgi?board=123/tech_ud&root=40&target=40&mode=tree&page=1
※常時接続でない方は上記参照の上DeviceProfileの設定にご注意。

110 :注意喚起!:2001/07/11(水) 20:47
自作PC板とラウンジのUDスレを荒らしているaddie(=ADY)の発言。
http://piza.2ch.net/test/read.cgi?bbs=jisaku&key=993141033&st=120&to=122&nofirst=true
addieのWebサイト
http://zoo.millto.net/~ady/index.html
ミラー
http://www.geocities.com/s_ady.geo/
掲示板
http://www.tcup2.com/246/ady.html

111 :            :2001/08/25(土) 18:43
まんまとトロイの木馬を受け入れてしまうお馬鹿の集まりですね。
コードがデータを盗む手助けをするかもしれず、一端事あれば
データを破壊するかもしれず、普段からパソコンの中の有用な
データ―がないかスパイしているかもしれないのに。安全とか
機密保持とかいうことをまったくしらない。

112 :あるケミストさん:01/08/29 00:05 ID:QrIgeRFw
あげます♪

113 :S.Inoue@army:01/09/04 00:30 ID:cbux6Spk
>>1-111
軍事板に来やがれ!
http://yasai.2ch.net/test/read.cgi?bbs=army&key=991290845
白血病が不治の病でなくなればそれでいいのさ。
個人のPCが少々データを盗まれたって、なんぼのもんじゃい!
(会社のPCじゃやらない方がいいぞ。)
ハードディスクを初期化してOSから再インストールすればいいのさ。
(Biosはやられませんように。)

114 :  :01/10/06 04:17
あなたのPCが乗っ取られて,おかしなメールの
送信元やある特定のサーバーを攻撃するいたずら
に加担してしまうかもしれないのですが。

115 :あるケミストさん:01/10/13 18:10
まず、Windowsをハズしましょうね>114

116 :あるケミストさん:01/11/03 01:51
自作で高性能のススメ
UDのためにCPUをDualにしました。

UD(白血病の解析)のProcessor Performanceで
100 Pentium 4 1.5GHz (基準)
103 Pentium III 1.0GHz
と出る。
CPUを購入し、それまでシングルだったDual対応マザーに足して
CPU×2にしたら解析速度が恐ろしく速くなりCPU使用率も前は常
に100%だったのが50%前後止まりになりました。

下はA for Benchというベンチマークソフトの実測結果をネットを
通じ自動集計したもの。
(なぜかPentium 4は遅い。)
http://kotan.ec.hokudai.ac.jp/~hiyohiyo/mark/ranking.cgi?version=afor:21&sort=mark&page=1
A for Bench ベンチマークソフト(無料)
http://www.vector.co.jp/soft/win95/hardware/se195539.html

UDはSMP非対応だがCPUの負担が減ってUDのソフトが早くなったのを体感できます。

CPUとUDの状況を画像化したのでUPしました。
処理はCPU二つに分散されているようです、
UD(白血病の解析)のProcessor Performanceで
100 Pentium 4 1.5GHz (基準)
103 Pentium III 1.0GHz
となっている。
http://www.geocities.co.jp/SiliconValley/6736/files/cpu.gif

117 :ななし:01/11/07 04:37
まぁ、解析速度が速いに越したことはないだろう。

【最速】UD:解析用最速パソコンの組み立て
http://pc.2ch.net/test/read.cgi/jisaku/1005062656/

118 :eml_leo@math ◆emlx2O2g :01/11/16 00:00
==== 分散コンピューティングをしよう - Team2ch@math へのお誘い=== =

□United Devices(以下UD)とは,白血病に関係すると思われる蛋白質
  に効果のある分子を参加メンバーのPCで解析するプロジェクトです。

□UDプロジェクトではチームを作ることができます。2chではTeam 2ch
  で参加しており、UD界最大最凶のチームとなっています。

□このTeam 2chには「チーム内チーム」というものがあります。UDに関心
  のある板では、各板でスレを立てTeam2ch内で競争しています。

□よく行く板が無い,板にUDのスレがない…実は一人板してます。と言う方!
  関心はあるけど、どの板のチームに入ればいいか分からないと言う貴方!
  是非、数学板のTeam2ch@mathでご一緒しませんか?

□参加資格は誰でもOK! 数学に興味がある,数学を愛している、数学
  なしでは飯の食い上げと言う貴方でも! 1=0.9999999…を証明できない!
  とか、2^50ってなんじゃ!(゚Д゚)ゴルァ!という数学板に縁がない貴方でも!
  中学,高校,大学では数学で痛い目にあったと言う方でも!大丈夫♪

□理系で研究室に所属している方!貴方の研究室の片隅に暇を持て余して
  いるマシーンはありませんか?UDプロジェクトにそういうマシーンを参加さ
  せては如何でしょう?Team2ch@mathは新人,移籍さんを大歓迎致します!

□詳しい参加方法などは下記のTeam2ch@mathスレにあります。
  http://cheese.2ch.net/test/read.cgi/math/1000538168/489-490
  http://cheese.2ch.net/test/read.cgi/math/1000538168/497

      皆様のご来訪を心待ちしております。
                                  Team2ch@math

119 :あるケミストさん:01/11/16 00:20
結局、化学板でUDのチームが作られないのはあまりにも本業に
近い人が多いからじゃないのかね。権利関係なんかはシャレに
ならんでしょ、ここの板の住人の場合。
いくら安全だからと言われても、そして俺も多分大丈夫だと思
ってはいるけど、他人のDrug Designを手伝う気にはなれない。

ちなみにおれは計算化学屋。さすがに空いてる時間にUDする気
にはなれない。

120 :あるケミストさん:01/12/26 16:50
俺は別に
PC監視されようがvirus送り込まれようが
パスワード盗まれようがアメリカが特許とって莫大に儲けようが
intelとmicrosoftの陰謀だろうが構わないよ。

それで人が助かるかもしれないならさ。

121 :あるケミストさん:01/12/27 00:55
>>120

禿動

122 :あるケミストさん:01/12/28 17:51
俺は
PC監視されてvirus送り込まれて
パスワード抜かれてアメリカが特許とって莫大に儲けて
intelとmicrosoftとpentagonの陰謀だったら許せんから入れてないよ。

人が助かったところで、その影でボロ儲けしている企業や国家がいるだろうからな。

123 :ミスプレ改 ◆cx9N86GU :02/04/04 01:19
まあ脳内エネミーオブアメリカやってる奴は入れる資格も無いし、
そんなこと関係なしという人は是非入れて実行してくだされな感じだな。

124 :あるケミストさん:02/04/04 01:22
おっとコテハンで書いちまった

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